团藏在火影忍者剧情中的登场是其角色塑造的关键设计，他并非在故事初期便活跃于台前，而是作为木叶村暗处势力的象征，在剧情发展到一定阶段后才正式现身。他的身份是火之国木叶村暗部地下组织根的领导者，与第三代火影猿飞日斩曾是同一时代的队友兼竞争对手，长期作为木叶的黑暗面存在，处理着许多无法见光的任务与决策，这一背景设定为他后续的出场埋下了深刻的伏笔。他之所以能在木叶内部横行却树敌无数而无人敢直接对抗，部分原因在于他掌控的根组织及其在木叶高层中的稳固地位与影响力。
团藏的正式亮相发生在剧情的中后期，具体而言是在疾风传阶段的五影会谈期间。他抓住纲手昏迷、木叶群龙无首的时机，以代理火影的身份代表木叶出席，其右眼和右臂缠满绷带的独特造型瞬间引发了观众与玩家的强烈好奇。这种安排并非偶然，而是因为他之前的活动一直受到第三代火影猿飞日斩的制约，当三代在位时，团藏的势力与行动受到压制，不敢过于张扬。直到三代牺牲，新任火影纲手上台，作为资历深厚的元老和顾问，团藏才认为时机成熟，开始从幕后走向台前，并时常与纲手发生争执以施加压力。他的登场方式充满了政治算计与权力斗争的意味。
尽管在五影会谈时才正式走到故事聚光灯下，但团藏的存在与活动早已渗透在之前的诸多关键事件之中。剧情揭示，他实际上是宇智波一族灭族惨案、晓组织黑化等悲剧背后的主要推手之一。他出于对宇智波一族的不信任与自身权力欲望，策划并推动了灭族计划，并在此过程中夺取了宇智波止水的万花筒写轮眼。他还曾联合雨隐村的首领山椒鱼半藏，用计害死了倡导和平的晓组织初期领袖弥彦，直接导致了长门的堕落与晓组织性质的彻底转变。为了获取力量，他不仅移植了大量写轮眼和初代火影的细胞，还曾与大蛇丸合作进行秘密研究，甚至指使手下盗取各国已故强者的尸体以图利用。这些幕后操作表明，他的出现是一个由暗到明、逐步揭示其庞大阴谋网络的过程。
他的登场并非简单的角色引入，而是将此前剧情中许多黑暗的线索收束于一点，深刻揭示了木叶村光鲜表象之下权力斗争的残酷与复杂。即使在他明知可能面对传说中的人物时，仍对自己的力量与谋划抱有相当的自信，这进一步凸显了其角色的定位与悲剧性。这种安排极大地增强了故事的悬念与深度，让玩家和观众在回顾剧情时，能更清晰地理解那些影响忍界格局的重大事件背后所隐藏的黑暗之手。
