组合拳技能是玩家在战斗中实现高爆发伤害和连招衔接的核心手段。这些技能通常由多名忍者协同释放，或通过特定忍术的叠加形成更强的攻击效果。灼遁光轮疾风漆黑矢零式是漩涡鸣人的风遁超大玉螺旋手里剑与宇智波佐助的炎遁须佐能乎加具土命融合而成的组合忍术，其破坏力足以对十尾造成重创。类似的组合忍术还包括威装须佐能乎，通过为九尾披上完全体须佐能乎的盔甲，极大提升防御与攻击能力，甚至能抵挡初代火影千手柱间的真数千手。
仙法五右卫门是另一种高威力的组合技能，由自来也的油遁、深作仙人的风遁和志麻仙人的火遁共同释放。这一技能不仅范围广，还能通过风遁增幅火油的燃烧效果，但需注意地形对威力的影响。火遁暴风乱舞是宇智波带土的标志性组合忍术，结合了万花筒写轮眼神威的空间能力与火遁的高爆发特性，尽管学习难度仅为B级，但若无神威的辅助则无法施展。
在游戏实战中，玩家需掌握技能释放的时机与组合逻辑。普通攻击与忍术的衔接可形成连招，而奥义与觉醒技能的叠加能最大化输出。部分组合技能还具备特殊机制，如太极螺旋丸需波风水门与漩涡鸣人查克拉共鸣才能触发。威装须佐能乎在对抗十尾人柱力或六道级敌人时表现尤为突出，但其持续时间较短，需合理规划使用节奏。
对于追求高难度操作的玩家，可尝试宇智波佐助忍者之路版本的技能组合。其强化普攻会根据敌人性别触发不同效果，而雷之手里剑与刃连凤仙火的空中释放变体可形成多段连击。猿飞未来博人传则通过技能命中后的强化机制提升伤害，例如风遁·旋风拳与魔幻·树缚杀的组合能实现远程起手与近身爆发。
